Las aguas termales proceden de las profundidades de la Tierra. Durante su largo recorrido hasta la superficie se van enriqueciendo con propiedades químicas y oligoelementos, adquiriendo al mismo tiempo sus propiedades biológicas.
Sus manantiales suelen aprovecharse debido a las propiedades de estas aguas y deben protegerse para evitar las infiltraciones provocadas por la actividad humana en la superficie de las cuencas hidrográficas. Dependiendo del suelo del que proceden, las aguas se utilizan para diversos fines terapéuticos.
Sin embargo, no dejan de ser verdaderos ecosistemas con múltiples interacciones y todas tienen propiedades biológicas que la mayoría de las veces resultan una incógnita. Como todas las aguas del planeta (superficiales, subterráneas, oceánicas...), las aguas termales son ricas en microorganismos que son esenciales y muy útiles para el ser humano y los ecosistemas.
Las propiedades de las aguas termales también provienen de los microorganismos que las habitan y que a menudo son muy específicos de la mineralidad de estas aguas. Su diversidad puede ser considerable y, cuando se aíslan y cultivan en el laboratorio, se pueden extraer y concentrar los principios activos para explotarlos a escala industrial.